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色谱柱固定相的选择是关键，一般从以下几个方面考虑
色谱柱是气液相的关键部件，主要由两大类组成，毛细管柱和填充柱，其中毛细管柱由两部分组成：管线和固定相，管线主要有熔融石英和不锈钢两种。固定相是色谱分离的关键，它有很多种，大多数是高分子量、热稳定性好的聚合物，这些聚合物是液体或胶，常用的是聚硅氧烷和聚乙二醇，还有另外常用的固定相是小的多孔颗粒，由聚合物和沸石组成，在色谱实验过程中选择合适的色谱柱对实验的顺利开展和实验结果的可靠性而言是十分重要的。
色谱柱固定相的选择是关键，一般从以下几个方面考虑：
1、气相色谱中，两种分析物由于其与固定相的相互作用不同而发生分离，因此必须选择一个与样品特性相匹配的固定相；
2、如果不知道使用何种固定相，可以从非极性和弱极性柱开始使用，如果效果不好，再按极性渐强的顺序选用中等极性直到高级性柱逐一尝试，直到有较令人满意的分析结果即可确定使用的柱极性；
3、低流失（“ms”）色谱柱通常更为惰性，有更高的温度上限，适用于MS检测器；
4、使用能够提供满意的分离度和分析时间的极性小的固定相，非极性固定相比极性固定相具有更长的使用寿命；
5、要使用和被分析物极性相近的固定相，使用这一选择方法常常是有效的；
6、如果被分析物具有不同的偶极和氢键力，改变使用具有不同偶极或氢键力（不一定大）的固定相后，会出现新的其他共流出物，所以新的固定相不一定提供更好的总分离度；
7、如果可能，要避免使用含有能使选择性检测器产生高响应值功能团的固定相，例如含有氰丙基的固定相，用NPD会产生不同比例的增大基线高度（由于柱流失）；
8、PLOT柱用于在高于室温的柱温下来分析气体样品。
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